政府財政通過設置“應付主權外債轉貸款”賬戶核算其增減變動情況。主權外債轉貸款該賬戶的貸方登記應付主權外債轉貸款的增加。借方登記應付主權外債轉貸款的減少。期末貸方余額反映本級政府財政尚未償還的主權外債轉貸款本金和利息。“應付主權外債轉貸款”賬戶應當設置“應付本金”和“應付利息”兩個明細賬戶，分別對應付本金和利息進行核算。
主權外債轉貸款的取得有兩種方式：借入主權外債轉貸款轉入本級財政存款。政府財政收到上級政府財政轉貸的主權外債資金時，主權外債轉貸款借記“其他財政存款”賬戶，貸記“債務轉貸收入”賬戶。根據債務管理部門轉來的相關資料，按照實際承擔的債務金額，借記“待償債凈資產”賬戶，貸記“應付主權外債轉貸款”賬戶。