黃河流域生態治理存在的問題具體如下：
黃河流域生態治理存在的主要問題有：壹是水土流失嚴重。陜西占中國黃土高原總面積的20%以上，是我國水土流失最為嚴重的區域之壹，黃河三門峽以上河段輸沙量的壹半、下遊粗沙淤積的90%均來自這裏。
陜西省黃河流域內煤炭資源的大規模開采誘發和加劇了原生地貌的水土流失進程，加劇了土地荒漠化；暴雨沖擊煤炭開采區產生富含粗泥沙的水流，改變了流域內自然的水沙關系，導致下遊河道的嚴重淤積。
二是流域水資源銳減，水質惡化。陜西省黃河流域的煤炭開采、河道采沙、開采地下水等人類活動，以及人口增長、經濟發展、城市化進程的加快、工農業和生活用水需求的增加等，是影響流域水資源減少的主要因素。
三是水資源供需矛盾突出。陜西省黃河流域國土面積和人口分別占全省的65%和76%，黃河為陜西承擔了83%以上工業用水和78%以上生活用水。
而流域人均水資源量只有447立方米，不足全國平均水平的1/5，是陜西生態環境脆弱、水資源短缺、貧困人口集中、區域發展不平衡矛盾最突出的區域。