5.學習費用不同:學術型碩士錄取為國家計劃內碩士研究生(非定向和定向)。從2014秋季學期開始，所有研究生開始自費；2010起，專業碩士與全日制學術型碩士基本壹致，國家計劃(非定向和定向)招收的碩士研究生按國家規定享受免學費待遇。作為計劃外招生(委托培養，自費)的研究生必須交學費，壹般是8000元/年，因專業而異。對於自費生、貧困生等考生，可以通過申請國家助學貸款或商業貸款來緩解學費壓力。
6.文憑發放可能有所不同:學術型碩士既發學位，也發學歷證書；10專業碩士單獨考試頒發學位證書，10考試頒發學位和畢業證。
7.社會認可度不同:學術型碩士是正規大學的全日制碩士，學歷和學位證書都有，所以這類畢業生的社會認可度很高。但企業在招聘時也會考慮到全日制研究生的軟肋:只有理論，缺乏經驗。尤其是對於碩士和本科學歷完全不壹樣的求職者，以及從未有過相關工作經驗的求職者，企業會有所顧忌。建議這類畢業生通過實習、兼職或者考職業證書來加強競爭力。