1、貸款利率不同
對於申請者而言,最關系的還屬貸款利率。公積金的貸款利率比商業貸款利率低,五年以內公積金貸款利率為4.0%,五年以上是4.5%。而商業貸款利率五年以上貸款利率為6.55,不同銀行所執行的貸款利率在這個基準利率之上有所浮動。
2、貸款機構主體不同
住房公積金貸款管理主體是住房公積金管理中心,而商業住房貸款管理主體是各商業銀行
3、貸款的資金來源不同
商業住房貸款資金來源是各商業銀行的自營資金(即吸收的居民或單位存款),而住房公積金貸款資金來源是職工個人及所在單位繳存的住房公積金。
擴展資料：
公積金的貸款條件
1、只有參加住房公積金制度的職工才有資格申請住房公積金貸款，沒有參加住房公積金制度的職工就不能申請住房公積金貸款。
2、參加住房公積金制度者要申請住房公積金個人購房貸款還必須符合以下條件：即申請貸款前連續繳存住房公積金的時間不少於六個月。因為，如果職工繳存住房公積金的行為不正常，時斷時續，說明其收入不穩定，發放貸款後容易產生風險。
3、配偶壹方申請了住房公積金貸款，在其未還清貸款本息之前，配偶雙方均不能再獲得住房公積金貸款。因為，住房公積金貸款是滿足職工家庭住房基本需求時提供的金融支持，是壹種"住房保障型"的金融支持。
4、貸款申請人在提出住房公積金貸款申請時，除必須具有較穩定的經濟收入和償還貸款的能力外，沒有尚未還清的數額較大、可能影響住房公積金貸款償還能力的其他債務。當職工有其他債務纏身時，再給予住房公積金貸款，風險就很大，違背了住房公積金安全運作的原則。
5、公積金貸款期限最長不超過30年。辦理組合貸款的，公積金貸款和商業性住房貸款的貸款期限必須壹致。
百度百科-公積金貸款