公積金貸款被拒的原因有三個:第壹，繳存公積金的時間不夠:目前許多公積金貸款政策中都有要求，申請公積金貸款通常需要半年或更長時間。如果繳存時間不夠，是無法申請公積金貸款的。
第二，公積金的繳存額少:公積金貸款的月供通常從公積金賬戶中扣除的資金中償還，借款人的月繳存額不得低於月供額，否則很難批準貸款。而且現在很多地方對公積金貸款額度都有限制。
三是有未結清的公積金貸款:可以用公積金貸款購買第二套房，但前提是首套房公積金貸款已結清。另壹方面，如果首套房公積金貸款無法結清，則無法辦理；如果以前用商業貸款買房，對二套房的公積金貸款沒有影響。