產業結構:與其他藥物不同，我國乃至世界海洋藥物的研發主體是高校和科研院所，導致海洋藥物的研發與企業產業化嚴重脫節，與市場需求缺乏緊密結合，海洋藥物的篩選研發與市場下遊環節嚴重脫節，導致國內外海洋藥物現有適應癥與非海洋藥物存在嚴重重疊。
資本投資有限:海洋生物醫藥行業的資本活動相對較低。近幾年融資的只有海基生物等幾筆。資金來源主要是政府資金和企業科技活動貸款，資金來源比較單壹。
技術要求高，投資大:海洋藥物資源種類繁多，但高度分散，難以富集，物質結構復雜，原料收集純化昂貴；在藥物研發產業化之前，需要有壹定批次的原料來研究藥物性質，因此海洋藥物原料的高成本和高技術要求嚴重制約了海洋藥物的發展。
政策:近年來，發展海洋生物醫藥產業已經上升到國家戰略的高度。《國民經濟和社會發展第十四個五年規劃綱要》和《2035年遠景目標綱要》提出了“積極拓展海洋經濟發展空間”，構建現代海洋產業體系，培育壯大海洋生物醫藥產業的戰略部署。海洋經濟發展“十四五”規劃提出，以深化供給側結構性改革為主線，以改革創新為根本動力，加快構建現代海洋產業體系，努力增強海洋科技自主創新能力。在國家戰略的指導下，各地陸續出臺了十五期間海洋經濟發展規劃，並結合自身發展實際，細化了海洋生物醫藥產業的發展方向。