1、資金使用方式不同：受托支付是指貸款每筆資金的使用需要經過銀行的審核。自主支付是指貸款資金可以由借款人自行使用。
2、用途不同：受托支付是符合貸款用途的方可使用，不符合貸款用途不可以使用。借款人自行使用，但借款人違反借款合同約定使用貸款資金的話，銀行有權隨時提前清收。
3、受托支付是貸款資金的壹種支付方式，指貸款人（依法設立的銀行業金融機構）根據借款人的提款申請和支付委托，將貸款資金支付給符合合同約定用途的借款人交易對象，目的是為了減小貸款被挪用的風險。受托支付適用的情況是貸款資金單筆金額超過項目總投資百分之5或超過500萬元人民幣。有助於提高商業銀行強化科學的貸款全流程管理貸款發放的質量，也有利於管理。