農村小額貸款公司以向稅務申請代開專票。按國稅總局關於全面實施營改增文件規定，貸款服務不能抵扣進項稅額，所以即使提供貸款服務的銀行是增值稅壹般納稅人也只能開具增值稅普票。沒有申請代開專票的必要，直接開具增值稅普通發票就好了。