海南金石源小額貸款有限公司未在相關部門進行備案登記，因此屬於非法機構。根據相關法律法規和監管要求，未經備案的貸款有限公司的行為是違法的。這意味著，海南金石源小額貸款有限公司提供的貸款雖然存在，但並不合法有效。由於其非法性質，該公司的貸款不會上報征信機構，也不會對個人的征信記錄產生影響。因此，海南金石源小額貸款有限公司的貸款不會出現在個人的征信報告中。