公積金還貸款的第壹種扣款方式是對沖還款。借款人可以選擇委托銀行提取個人公積金賬戶余額中的資金，用於支付每月的貸款月供。在還房貸期間，借款人可以從公積金賬戶中提取資金進行提前還款。例如，借款人每年可以從公積金賬戶中提取壹次資金，用於提前償還房貸。
公積金還貸款的第二種扣款方式是按期還款。在貸款時，借款人需要綁定自己的銀行卡。到了還款日，系統會自動從綁定的銀行卡中扣款，用於支付貸款的月供。