東莞新房首付比例是三成，首套房和二套房主要有以下三種區別：
1、首付比例有區別
東莞首套房首付比例仍維持三成以上的標準；貸款購買第二套住房的家庭，嚴格執行首付款比例不低於60%的標準。
2、貸款利率有區別
首套房的貸款利率是基準利率，而二套房的貸款利率不低於基準利率的1.1倍。在國家統壹信貸政策的基礎上，東莞還可能適時提高第二套住房貸款的首付款比例和利率下限。購房者應仔細分清其中的差別。
3、還貸壓力有區別
東莞首套房的首付比例低，貸款利率低，還貸壓力小；二套房則不然，首付比例高於六成，因此還貸壓力過高。購買二套房時應謹慎而為、量力而行，不應增添過多的經濟負擔。