小額信貸的運營成本太高。小額貸款屬於零售貸款。壹個信貸員最多能營銷壹兩百筆貸款，但金額只有幾百萬，跟批發貸款的規模效應沒法比，相對成本也高。也是壹個億的貸款。如果給大企業貸款，只需要壹個客戶經理來辦理，而辦理壹筆小額貸款可能要上千筆，只需要十幾個客戶經理。人力物力成本太高。
整個社會誠信體系缺失，小額貸款大多依靠信用擔保，但很多貸款人將小額貸款視為“唐僧肉”，救災、扶貧、逃廢、詐騙等惡意行為時有發生。